A Central de Análise e Prospecção Química (CAPQ) da UFLA, localizada no Departamento de Química, foi criada em abril de 2004 por projeto contemplado pela FINEP, via direção da UFLA. É um laboratório multiusuário vinculado à Pró Reitoria de Pesquisa. Possui uma estrutura com vários laboratórios, os quais contêm equipamentos de ponta, que auxiliam no desenvolvimento da pesquisa na universidade. Os equipamentos atualmente operantes no laboratório são: Cromatografia Gasosa Acoplada a Espectrometria de Massas (GC/MS), Cromatografia Gasosa com Detector de Ionização de chama, Análise termogravimétrica (TGA) e Análise Térmica Diferencial (DTA), Calorimetria Diferencial Exploratória (DSC), Espectroscopia de Infravermelho e Cromatografia Líquida de Alta Eficiência (HPLC).

Sob a coordenação do Prof. Mário César Guerreiro, os laboratórios pertencentes ao CAPQ atendem a comunidade acadêmica e contam com o apoio de duas técnicas-administrativas (nível E e nível D). Os laboratórios do CAPQ dão sustentação aos programas de pós-graduação do DQI e também dá suporte técnico-científico aos outros departamentos da universidade, atendendo pesquisas na área ambiental, analítica, orgânica, inorgânica, de alimentos e farmacológica.